1月25-31日，由本山传媒集团资助，中华儿慈会青爱工程专项基金主办，北京青爱教育基金会承办，民进中央支持的“青爱工程首期种子师资培训·第二期(2016年寒假班)”在京举行。来自北京、河北、黑龙江、辽宁、甘肃、陕西、河南、山东、江苏、四川、重庆、云南、青海等地的青爱小屋专责教师50人参加了培训。

4月16日，“天下母亲 以爱抗艾”倡议活动恳谈会在京举行，来自联合国艾滋病规划署驻华代表处、加拿大华人华侨社团以及北京、山东、河南、云南等地代表，计40多人出席会议。

5月15-21日，联合国艾滋病规划署驻华代表处、青爱工程联合在云南省盈江县开展青爱小屋项目评估。省、州、县各级领导5人;走访青爱小屋学校33所(幼儿园2所、小学18所、初中10所、高中3所)，访谈校领导、小屋专责教师、学生及家长160余人;完成教师、学生问卷1900余份。

5月18日，云南民族大学附属中学、昆明市五华区桃源实验学校、昆明市五华区联家小学3所学校青爱小屋挂牌。

5月19日，青爱工程湖北基地(010号)成立，华中师范大学、宜昌市西陵区桃花岭小学等23所学校青爱小屋也同期授牌。全国人大常委、全国人大教科文卫委员会副主任委员、青爱工程首席顾问王佐书，中国教育学会常务副会长戴家干出席授牌仪式。

6月7日，《中国第三部门观察报告(2016)》新书发布暨中国第三部门观察论坛在京举行。作为观察中国第三部门发展的权威报告，“青爱工程：公益组织的超前社会实验”作为典型案例入选。《报告》认为：面对一个尴尬、棘手、少被关注且很难进行公众筹款的社会问题——艾滋病防治，中国青少年艾滋病防治教育工程(简称“青爱工程”)，以青少年爱的教育为使命，通过筹集社会资金，在全国大中小学幼儿园援建青爱小屋，持续探索符合中国国情及学生年龄特点的健康教育模式。 青爱工程于2006年12月启动，至今历时近10年时间，从扎实落地，到终见彩虹，可谓是一场全民教育的社会工程，是超前的社会实验。

6月12-14日，全国人大教科文卫委副主任委员、青爱工程首席顾问王佐书，中国教育学会常务副会长戴家干到江苏省南通市、江阴市的青爱小屋学校、社区走访调研，了解项目活动开展情况，并参加了南通市崇川区第二批30所青爱小屋的授牌仪式。

6月17-25日，青爱工程邀请人民日报海外版、中央电视台外文频道、中国国际广播电台、中国日报、中国外文局下属外文期刊(《北京周报》)等5家中央外宣媒体，到云南省盈江县、四川省成都市和都江堰市三地进行了为期一周的实地采访，宣传报道青爱小屋项目在当地的开展情况。

7月8日，北京青爱教育基金会召开第一届理事会第五次会议，会议增选吴国平、邢海燕、彭正华为理事;选举单以山担任副理事长、邢海燕担任秘书长、彭正华担任副秘书长;同意李启胜辞去理事会秘书长职务。

7月18-24日，由本山传媒资金支持的“青爱工程首届性教育种子师资培训·第三次(2016暑期)”如期开班，来自河南、河北、黑龙江、江苏、山东、陕西、四川、内蒙古、重庆、青海、云南等地的42位青爱小屋老师参加培训。

7月18日,为期五天的第二十一届世界艾滋病大会在南非德班开幕。青爱工程专家委员会委员、UNAIDS督导评估和策略信息顾问陈仲丹博士代表青爱工程参加了大会，向世界各国社会组织介绍了青爱工程在青少年艾滋病防治方面所做的工作和取得的成绩。此次大会以“现在就获得平等权利”为主题，重点讨论如何在2030年在全球范围消灭艾滋病。来自世界各地的政要、科学家、医疗工作者、社会组织代表，艾滋病病毒感染者代表等1.8万人出席本次会议。

9月8日，联合国副秘书长、联合国艾滋病规划署执行主任米歇尔·西迪贝带领他的中方、外方同事一行近二十人，来到云南省瑞丽市民族中学，考察青爱小屋的工作，盛赞中国式性教育。青爱工程首席顾问、全国人大教科文卫副主任委员王佐书，联合国艾滋病规划署驻中国代表苏凯琳、联合国艾滋病规划署亚太区主任克劳斯、联合国艾滋病规划署驻缅甸代表墨菲、联合国艾滋病规划署驻缅甸办事处项目官员塞隆提等一同到访学校。米歇尔·西迪贝先生受聘为青爱工程委员会外方主任。

10月14日，青爱工程玉溪市元江县工作站(007号)挂牌成立。元江县第四小学等19所学校青爱小屋授牌。

10月15-17日，由“本山传媒”资金支持的青爱工程2016年云南省德宏州师资培训开课，来自芒市、瑞丽市、盈江县、梁河县、陇川县96所青爱小屋的250多名老师参加了此次培训。

10月30日晚，青爱工程与北京弘道慈善基金会联合主办关爱艾滋病患者“Blue Note 防艾公益爵士音乐会”。

11月4日，云南省高校“青爱工程”启动仪式暨“青爱小屋”授牌仪式云南警官学院举行。云南大学、昆明医科大学、云南师范大学、云南警官学院、曲靖师范学院、云南师范大学商学院、云南经济管理学院成为云南省首批青爱小屋试点高校。

11月16-17日，第四届尼山世界文明论坛在山东曲阜举行。首次设立“世界女性论坛”成为本届文明论坛的一大亮点。此次女性论坛以“女性与人类可持续发展议程”为主题，与会国内外学者共同探讨性别平等与可持续发展、女性与健康生活方式、女性与社会公益以及女性与文化传承等话题，并签名通过了《世界女性尼山共识》，和为《世界女性尼山共识》碑揭幕。青爱工程办公室主任、北京青爱教育基金会理事长、尼山世界文明论坛执行主席张银俊女士在论坛上发言。联合国妇女署驻华代表汤竹丽出席论坛，联合国妇女署副署长普瑞女士、联合国秘书长潘基文夫人柳淳泽女士为论坛发来贺函。

11月25日，“以爱抗艾·保护生命”黑龙江省青爱工程启动暨青爱小屋授牌仪式在哈尔滨理工大学举行。

全国人大常委、全国人大教科文卫委员会副主任委员、中国青爱工程首席顾问王佐书出席仪式并为青爱工程黑龙江基地(011号)揭牌。哈尔滨理工大学、哈尔滨市南岗区通达街道办事处、青龙山农场学校等20所首批示范青爱小屋也同期授牌。

11月30日，第29个“世界艾滋病日”前夕，“携手抗艾·重在预防”北京丰台区首批青爱小屋授牌仪式在北京师范大学第四附属中学举行。

北京市丰台区职业教育中心学校、北京师范大学第四附属中学、北京市首都师范大学附属丽泽中学、北京市丰台区东铁匠营第二中学、北京市西罗园学校、 首都师范大学附属云岗中学、北京小学丰台万年花城分校、北京市丰台区师范学校附属小学、北京市丰台区纪家庙小学、北京市丰台区第三幼儿园成为首批选定的10所青爱小屋项目试点学校。“青爱工程北京市丰台区工作站(008号)”也同期成立挂牌。

全国人大常务委员会委员、教科文卫委员会副主任委员、青爱工程首席顾问王佐书，著名教育家、中国教育学会名誉会长、青爱工程领导小组组长顾明远，丰台区副区长张鑫、北京市卫生和计划生育委员会郑晋普等出席并讲话，呼吁关注青少年健康教育，提高学生群体防病意识，促进身心健康，提高生活质量。

11月30日，第000679号“青爱小屋”在湖北省随州市均川镇第二小学授牌。这间小屋由国网随州供电公司“光满·爱心红丝带”共产党员服务队援建。它的落成在随州乃至湖北的防艾抗艾领域都具有重要意义。企业、社会携手防艾抗艾，向2030年零艾滋目标迈进。

11月30日晚，以“携手抗艾 重在预防”为主题的“爱之声”防艾公益音乐会在北京举行。活动由中国预防性病艾滋病基金会主办，北京青爱教育基金会、北京弘道慈善基金会协办。

12月1日，第29个世界艾滋病日，“青春以爱抗艾 • 音乐点亮人生”大型公益音乐会于2016年12月1日在北京大学百周年纪念讲堂举行。

本次活动以期用学生喜闻乐见的高雅音乐会的方式，用音乐唤起对艾滋病毒感染者的关爱，用音乐唤起广大高校学生对艾滋病防治教育的重视，用音乐唤起社会各界对青少年防艾工作的支持。

活动由中国青少年艾滋病防治教育工程、满天星业余交响乐团和共青团北京大学委员会主办，中国性病艾滋病防治协会、中华少年儿童慈善救助基金会、中华红丝带基金、中国预防性病艾滋病基金会联合主办，北京青爱教育基金会承办。

第十一届全国政协副主席、全国工商联名誉主席、中华红丝带基金名誉理事长黄孟复，全国人大常务委员会委员、全国人大教科文卫委员会副主任委员、原民进中央副主席、青爱工程首席顾问王佐书，全国政协文史和学习委员会副主任、北京青爱教育基金会名誉会长叶小文，全国工商联副主席、中华红丝带基金理事长谢经荣、中国预防性病艾滋病基金会理事长、北京青爱教育基金会名誉会长、原总后勤部卫生部副部长王玉民，国家卫计委疾病预防控制局副局长夏刚，中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心主任吴尊友，中国青少年艾滋病防治教育工程办公室主任、北京青爱教育基金会理事长张银俊以及其他社会各界人士2000余人参加了此次主题音乐会活动。

12月1日，南通市崇川区第三批19所社区青爱小屋授牌，至此，崇川区青爱小屋达到66所。